Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms