Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaaf4Q8R368 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnaaf4Q8R368 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnaaf4Q8R368 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnaaf4Q8R368 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnaaf4Q8R368 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms