Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc12Q8R344 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc12Q8R344 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms