Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b4Q8QZY9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b4Q8QZY9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms