Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lin28aQ8K3Y3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lin28aQ8K3Y3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms