Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms