Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ncapd2Q8K2Z4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms