Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms