Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccm2Q8K2Y9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms