Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Depp1Q8K2F3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Depp1Q8K2F3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Depp1Q8K2F3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Depp1Q8K2F3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Depp1Q8K2F3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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