Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms