Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prkd3Q8K1Y2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms