Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh3Q8K1E6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms