Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot3Q8K0V4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot3Q8K0V4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms