Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms