Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina11Q8CIE0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Serpina11Q8CIE0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms