Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hpf1Q8CFE2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms