Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ercc8Q8CFD5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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