Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms