Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl11Q8CE33 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms