Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph6aQ8CDR2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsph6aQ8CDR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms