Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc87Q8CDL9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc87Q8CDL9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms