Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RybpQ8CCI5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms