Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrn3Q8CBC6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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