Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nhsl1Q8CAF4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms