Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Atg4aQ8C9S8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Atg4aQ8C9S8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Atg4aQ8C9S8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Atg4aQ8C9S8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Atg4aQ8C9S8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg4aQ8C9S8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4aQ8C9S8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4aQ8C9S8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atg4aQ8C9S8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4aQ8C9S8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Atg4aQ8C9S8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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