Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe22Q8C6A8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms