Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc113Q8C5T8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Ccdc113Q8C5T8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Ccdc113Q8C5T8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Ccdc113Q8C5T8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Ccdc113Q8C5T8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc113Q8C5T8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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