Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot2Q8C5L3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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