Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms