Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc90bQ8C3X2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc90bQ8C3X2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms