Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska3Q8C263 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ska3Q8C263 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms