Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc21aQ8C0S4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ttc21aQ8C0S4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ttc21aQ8C0S4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ttc21aQ8C0S4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ttc21aQ8C0S4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Ttc21aQ8C0S4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc21aQ8C0S4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21aQ8C0S4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21aQ8C0S4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc21aQ8C0S4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21aQ8C0S4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21aQ8C0S4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Ttc21aQ8C0S4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc21aQ8C0S4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms