Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp47Q8BY87 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp47Q8BY87 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms