Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn17Q8BXA6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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