Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms