Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp38Q8BW70 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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