Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pggt1bQ8BUY9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pggt1bQ8BUY9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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