Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab3gap2Q8BMG7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms