Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tspan12Q8BKT6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms