Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIS8

Ccdc126, Coiled-coil domain-containing protein 126, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc126Q8BIS8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc126Q8BIS8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc126Q8BIS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms