Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF8

Slc35d3, Solute carrier family 35 member D3, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35d3Q8BGF8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35d3Q8BGF8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35d3Q8BGF8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms