Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms