Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pkhd1l1Q80ZA4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms