Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbbp8Q80YR6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbbp8Q80YR6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms