Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npm2Q80W85 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Npm2Q80W85 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm2Q80W85 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms