Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sestd1Q80UK0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sestd1Q80UK0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sestd1Q80UK0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sestd1Q80UK0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms