Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep170bQ80U49 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep170bQ80U49 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep170bQ80U49 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms