Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul9Q80TT8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul9Q80TT8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms