Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf8Q80TJ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms